中国口岸协会于1994年5月6日成立，是经中华人民共和国民政部登记注册，海关总署为原业务主管单位，国家口岸管理办公室为指导单位，由与口岸业务相关的企事业单位、社会团体、科研院所等有关单位和个人自愿结成的全国性、专业性社会团体，是非营利性社会组织。
2016年10月28日，中国口岸协会在北京召开第五次全国会员代表大会，选举产生了新一届理事会。会议选举中国远洋海运集团有限公司董事长、党组书记许立荣为会长的新一届协会领导班子。海关总署原党组成员、国家口岸管理办公室原主任黄胜强同志担任名誉会长。协会常设机构实行会长办公会和秘书长例会制度。协会会员已覆盖全国22个省市，分别来自航运、物流、港口、贸易、船舶制造、铁路运输、机械制造、软件开发、金融等不同行业。
协会成立以来，得到了党和国家领导人的亲切关怀
时任国务院总理李鹏，时任国务院副总理李岚清，时任全国人大常委会副委员长田纪云为协会题词
协会严格按《中国口岸协会章程》办事，贴近口岸实际，逐步形成了科学务实的办会理念。组织全国各地口岸协会和广大会员，坚持以“为政府部门和相关企事业单位服务，为口岸有效监管和文明高效服务，为促进国际经济贸易和国际交往服务”为导向，努力发挥协会桥梁纽带、参谋助手作用，积极开展各类活动。
与南开大学经济与发展研究院 签署合作协议
与上海海关学院 签署战略框架协议
与北京临空国际技术研究院签署战略框架合作协议
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